Ai Haibara (nama asli Shiho Miyano alias Sherry). Seorang wanita dengan tiga identitas, yang berani menghadapi takdirnya. Shiho Miyano (nama kode: Sherry), seorang ilmuwan dan anggota Organisasi Hitam. Organisasi itulah yang mengembangkan racun misterius APTX (Apotoxin) 4869, obat yang mengubah Shinichi Kudo menjadi anak kecil! Namun, ketika Sherry menyadari bahwa Organisasi Hitam telah membunuh saudara perempuannya Akemi, dia mengkhianati Organisasi Hitam dan memutuskan untuk mengambil APTX4869. Obat tersebut mengubahnya menjadi seorang gadis kecil, dan dia memutuskan untuk menyebut dirinya Ai Haibara untuk bersembunyi dari Organisasi Hitam. Namun perlahan tapi pasti, Organisasi Hitam mulai membayangi dirinya.